Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hoxc11P31313 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hoxc11P31313 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hoxc11P31313 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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