Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VtnP29788 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VtnP29788 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VtnP29788 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VtnP29788 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VtnP29788 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VtnP29788 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VtnP29788 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VtnP29788 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VtnP29788 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VtnP29788 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VtnP29788 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VtnP29788 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VtnP29788 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VtnP29788 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VtnP29788 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VtnP29788 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VtnP29788 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VtnP29788 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VtnP29788 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VtnP29788 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VtnP29788 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VtnP29788 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VtnP29788 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VtnP29788 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VtnP29788 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VtnP29788 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VtnP29788 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VtnP29788 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VtnP29788 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VtnP29788 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VtnP29788 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VtnP29788 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VtnP29788 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VtnP29788 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
VtnP29788 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VtnP29788 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VtnP29788 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms