Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprmP28828 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprmP28828 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprmP28828 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprmP28828 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprmP28828 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprmP28828 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprmP28828 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprmP28828 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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