Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms