Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hoxd12P23812 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hoxd12P23812 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hoxd12P23812 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms