Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms