Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VimP20152 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VimP20152 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VimP20152 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VimP20152 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VimP20152 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VimP20152 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VimP20152 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VimP20152 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VimP20152 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VimP20152 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VimP20152 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VimP20152 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VimP20152 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VimP20152 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VimP20152 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VimP20152 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VimP20152 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VimP20152 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VimP20152 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VimP20152 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VimP20152 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VimP20152 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VimP20152 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VimP20152 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VimP20152 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VimP20152 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VimP20152 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VimP20152 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VimP20152 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VimP20152 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VimP20152 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VimP20152 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VimP20152 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VimP20152 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VimP20152 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VimP20152 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VimP20152 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VimP20152 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VimP20152 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VimP20152 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VimP20152 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VimP20152 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VimP20152 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VimP20152 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VimP20152 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VimP20152 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VimP20152 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VimP20152 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VimP20152 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VimP20152 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VimP20152 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VimP20152 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VimP20152 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VimP20152 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VimP20152 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VimP20152 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VimP20152 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VimP20152 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VimP20152 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VimP20152 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VimP20152 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VimP20152 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VimP20152 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VimP20152 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VimP20152 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VimP20152 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VimP20152 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VimP20152 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VimP20152 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VimP20152 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VimP20152 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms