Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NefhP19246 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NefhP19246 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NefhP19246 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NefhP19246 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NefhP19246 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NefhP19246 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NefhP19246 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NefhP19246 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms