Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RargP18911 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RargP18911 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RargP18911 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RargP18911 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RargP18911 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RargP18911 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RargP18911 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RargP18911 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RargP18911 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RargP18911 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RargP18911 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RargP18911 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RargP18911 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RargP18911 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RargP18911 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RargP18911 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RargP18911 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RargP18911 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RargP18911 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RargP18911 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RargP18911 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RargP18911 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RargP18911 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RargP18911 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RargP18911 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RargP18911 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RargP18911 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RargP18911 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RargP18911 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RargP18911 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RargP18911 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RargP18911 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RargP18911 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RargP18911 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RargP18911 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RargP18911 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RargP18911 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RargP18911 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RargP18911 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RargP18911 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RargP18911 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RargP18911 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RargP18911 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RargP18911 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RargP18911 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RargP18911 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RargP18911 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RargP18911 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RargP18911 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RargP18911 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RargP18911 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RargP18911 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RargP18911 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RargP18911 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RargP18911 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RargP18911 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RargP18911 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RargP18911 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RargP18911 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RargP18911 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RargP18911 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RargP18911 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RargP18911 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RargP18911 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RargP18911 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RargP18911 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RargP18911 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RargP18911 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RargP18911 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RargP18911 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RargP18911 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RargP18911 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RargP18911 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RargP18911 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms