Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PcnaP17918 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcnaP17918 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcnaP17918 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms