Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms