Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54P14576 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54P14576 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54P14576 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Srp54P14576 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54P14576 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Srp54P14576 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54P14576 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms