Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms