Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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