Protein–RNA interactions for Protein: P06329

Ig heavy chain V region AC38 15.3, mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06329 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06329 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06329 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06329 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06329 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06329 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P06329 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06329 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06329 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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