Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dync1i1O88485 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms