Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm10509O88255 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm10509O88255 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm10509O88255 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm10509O88255 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm10509O88255 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Gm10509O88255 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Gm10509O88255 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Gm10509O88255 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Gm10509O88255 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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