Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms