Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms