Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms