Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Copb2O55029 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Copb2O55029 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copb2O55029 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copb2O55029 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms