Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FxnO35943 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FxnO35943 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FxnO35943 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FxnO35943 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FxnO35943 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FxnO35943 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
FxnO35943 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FxnO35943 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FxnO35943 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FxnO35943 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FxnO35943 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FxnO35943 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FxnO35943 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FxnO35943 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FxnO35943 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FxnO35943 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FxnO35943 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FxnO35943 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FxnO35943 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FxnO35943 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FxnO35943 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FxnO35943 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FxnO35943 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FxnO35943 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FxnO35943 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FxnO35943 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FxnO35943 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FxnO35943 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FxnO35943 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FxnO35943 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FxnO35943 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FxnO35943 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FxnO35943 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FxnO35943 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FxnO35943 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FxnO35943 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FxnO35943 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FxnO35943 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FxnO35943 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FxnO35943 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FxnO35943 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FxnO35943 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FxnO35943 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FxnO35943 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FxnO35943 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FxnO35943 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FxnO35943 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FxnO35943 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FxnO35943 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FxnO35943 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FxnO35943 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FxnO35943 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FxnO35943 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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