Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops5O35864 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops5O35864 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops5O35864 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops5O35864 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops5O35864 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops5O35864 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cops5O35864 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cops5O35864 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cops5O35864 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cops5O35864 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cops5O35864 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cops5O35864 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cops5O35864 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cops5O35864 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cops5O35864 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cops5O35864 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cops5O35864 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cops5O35864 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms