Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Tnfrsf18O35714 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Tnfrsf18O35714 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Tnfrsf18O35714 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Tnfrsf18O35714 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Tnfrsf18O35714 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Tnfrsf18O35714 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Tnfrsf18O35714 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Tnfrsf18O35714 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms