Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atf6bO35451 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atf6bO35451 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atf6bO35451 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms