Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms