Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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