Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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