Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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