Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms