Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cldn20G5E8X0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cldn20G5E8X0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cldn20G5E8X0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cldn20G5E8X0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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