Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms