Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms