Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms