Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms