Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DspE9Q557 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DspE9Q557 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
DspE9Q557 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
DspE9Q557 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms