Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms