Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
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