Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms