Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms