Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms