Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms