Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl3E0CZ16 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl3E0CZ16 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl3E0CZ16 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl3E0CZ16 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl3E0CZ16 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl3E0CZ16 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl3E0CZ16 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl3E0CZ16 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl3E0CZ16 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl3E0CZ16 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl3E0CZ16 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl3E0CZ16 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl3E0CZ16 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl3E0CZ16 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl3E0CZ16 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms