Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms