Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms