Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rfx8D3YU81 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rfx8D3YU81 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rfx8D3YU81 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Rfx8D3YU81 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rfx8D3YU81 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rfx8D3YU81 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rfx8D3YU81 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rfx8D3YU81 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rfx8D3YU81 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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