Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms