Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rd3lB2RV38 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rd3lB2RV38 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rd3lB2RV38 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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