Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Usf3B2RUQ2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Usf3B2RUQ2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Usf3B2RUQ2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Usf3B2RUQ2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Usf3B2RUQ2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Usf3B2RUQ2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Usf3B2RUQ2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Usf3B2RUQ2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Usf3B2RUQ2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Usf3B2RUQ2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Usf3B2RUQ2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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