Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms